根據英國衛生安全局報告指出，針對581位完全接種二劑AZ或BNT疫苗的民眾，發現兩劑BNT疫苗接種25周後對Omicron的保護力只有40%，兩劑AZ疫苗接種25周後只剩10%。所以僅施打兩劑疫苗後，造成Omicron突破性感染的比率相對較高。
 
台南新樓醫院感染科蔡國聖主任指出，接種第三劑疫苗有三大理由：第一、大幅提升體內抗體效價，降低感染病毒風險；第二、增加體內抗體中和Omicron的能力，降低感染後引發重症或死亡風險；第三、延長抗體效價時間，持續維持保護力。若想接種第三劑，應符合以下三條件：1.年滿18歲；2.不論任何廠牌，已經完成兩劑疫苗接種；3.與第二劑疫苗接種時間已間隔三個月。（因應桃園出現Omicron變異株的群聚感染事件，指揮中心已於1月7日宣布，將第三劑接種時間從五個月縮短為三個月）。同時，符合以下條件者應優先接種：1. 65歲以上長者。2.長照機構工作者與住民。3.新冠疫苗公費接種對象第一、二、三類：醫事人員、防疫人員與高接觸風險第一線工作人員。4.新冠疫苗公費接種對象第九類：易感染與疾病高風險病患。
 
至於第三劑疫苗該怎麼選？蔡主任建議，可優先選擇mRNA疫苗，如莫德納、BNT疫苗或蛋白質疫苗，如高端。AZ疫苗第三劑的效果較不顯著，因此不推薦作為追加劑。衛福部ACIP表示，民眾若對其他疫苗過敏，仍可與醫師討論是否選擇AZ疫苗作為追加劑。還有第三劑疫苗的實質保護力有多高？根據以色列發表於《刺胳針The Lancet》醫學期刊的第三劑效果大型研究：728,231人繼2劑BNT疫苗5個月後，再施打第3劑BNT，中和抗體水平較第二劑時飆高10倍，能夠提供高達92%的重症保護力、93%的住院保護力、81%死亡保護力。英國一則針對50歲以上民眾的研究發現，接種2劑AZ疫苗5個月後追加一劑BNT，感染保護力從44.1%升到93.1%；若接種2劑為BNT疫苗，感染保護力可從62.5%升到94.0%。